Master parcours Microbiologie (MICROBIO)

Résumé

Par ses 2 spécialités, le parcours Microbiologie forme les étudiants et étudiantes aux avancées conceptuelles et méthodologiques récentes dans les domaines de la microbiologie fondamentale, du diagnostic et des biotechnologies.

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Call to actions

Secrétariat pédagogique
M1 BT-Microbio
METENIER Denise
UNIVERSITÉ TOULOUSE III - Paul Sabatier
Bâtiment U3 - Bureau 111
118 route de Narbonne
31062 Toulouse cedex 09
denise.metenier@univ-tlse3.fr
05 61 55 89 64

M2 BT-Microbio
METENIER Denise
UNIVERSITÉ TOULOUSE III - Paul Sabatier
Bâtiment U3 - Bureau 111
118 route de Narbonne
31062 Toulouse cedex 09
denise.metenier@univ-tlse3.fr
05 61 55 89 64
Contacts internationaux
WALTERS Adam
fsi-contact.relations-internationales@univ-tlse3.fr
Contacts formation continue
CRESSAULT Yann
fsi-contact.formation-continue@univ-tlse3.fr
Responsable(s) de la formation
M1 BT-Microbio
CASTANIE-CORNET Marie-Pierre
marie-pierre.castanie-cornet@univ-tlse3.fr

LE BOURGEOIS Pascal
pascal.lebourgeois@univ-tlse3.fr

ROUSSEAU Philippe
philippe.rousseau@univ-tlse3.fr

M2 BT-Microbio
CASTANIE-CORNET Marie-Pierre
marie-pierre.castanie-cornet@univ-tlse3.fr

LE BOURGEOIS Pascal
pascal.lebourgeois@univ-tlse3.fr

Composante

Inscription

Détails

Infos clés

Composante

  • Faculté sciences et ingénierie

Lieu(x) des enseignements

  • Toulouse - 118 rte de Narbonne

Niveau d'admission

  • Bac + 3

Niveau de sortie

  • Bac + 5 (Niveau 7)

Langue(s) d'enseignement

  • Français

Stage(s)

Oui, obligatoire(s)

Les +

Label(s)

Financement région

Domaine(s) de compétence

  • Sciences du vivant

Aménagement(s) des études

  • Etudiant en situation de handicap
  • Etudiant entrepreneur
  • Etudiant salarié
  • Sportif et Artiste de haut niveau

Présentation de la formation

Le parcours Microbiologie a pour objectif de délivrer une formation à et par la recherche permettant une compréhension fine des processus fondamentaux des microorganismes et de leurs interactions avec l'environnement. Ce parcours permet également d'acquérir des compétences approfondies pour le développement et la mise en œuvre de méthodes innovantes dans l'étude, l'identification et la modification de microorganismes ou d'écosystèmes microbiens complexes. L'enseignement dispensé lors des deux années permet une orientation progressive vers deux spécialités complémentaires , l'une plutôt orientée connaissance des microorganismes (spécialité Microbiologie Moléculaire , MM) et l'autre plutôt orientée identification et utilisation des microorganismes (spécialité Biotechnologie et Diagnostic des Microorganismes , BDM), permettant à chacun·e d'élaborer son projet professionnel. Cette spécialisation s'effectuera à partir du deuxième semestre de M1 avec le choix de certaines UE plus spécifiques permettant de s'orienter vers la spécialité souhaitée pour l'année de M2. En deuxieme année, les deux spécialités disposent d'un socle méthodologique commun (70 h TD/TP), puis se différencient par l'organisation de leur enseignement, essentiellement sous forme d'ateliers thématiques tutorés et de projets de recherche (130 h de présentiel) pour MM , et plus classique et orienté méthodologies/science de l'ingénieur (230 h de présentiel) pour BDM. Certain·e·s étudiant·e·s du parcours Microbiologie font partie de l'équipe INSA-UPS participante au concours de biologie synthétique iGEM

Connaissances

Thématiques scientifiques abordées au cours de la formation :
  • Génomique fonctionnelle et structurale des microorganismes;
  • Organisation, dynamique et plasticité des génomes microbiens et viraux;
  • Expression génique et sa régulation : transcriptomique et protéomique;
  • Mécanismes physiologiques et génétiques assurant le développement des microorganismes;
  • Interactions microorganismes / environnement;
  • Interactions microorganismes / hôtes animaux ou végétaux dans les relations saprophytes; symbiotiques ou pathogènes;
  • Signalisations et interactions microbiennes;
  • Populations microbiennes en milieux complexes.
  • Ingénierie des génomes dans le cadre de la biologie synthétique;
  • Nouveaux outils de diagnostic des microorganismes (NGS, métabarcoding, génotypage,…)

Aménagements des études et Labels

Le parcours Microbiologie est accrédité par la région Occitanie (programme "For Pro Sup") et peut donner droit à un financement via la Mission Formation Continue et Apprentissage (MFCA) de l'université.

Lieu(x) des enseignements

Toulouse - 118 rte de Narbonne

Durée de la formation

2 ans

Partenariats

Laboratoires

Les membres des laboratoires de microbiologie du bassin toulousain (IPBS, LMGM, LIPME, LRSV, ENVT, Toxalim, TBI-INSA, IRSD) interviennent dans les enseignements de M2 (ateliers tutorés et projets de recherche) et dans la proposition de sujets de stage de fin d'étude.

Entreprises

De nombreuses entreprises sont associées à la formation comme terrain de stage de fin d'étude et commanditaires de travaux bibliographiques lors des ateliers thématiques.
Liste non exhaustive :
Biomérieux, Véolia, Sanofi-Aventis, Pierre Fabre, Institut Pasteur, Danisco, 3A groupe, ANSES, IFREMER, CIRAD, Agronutrition, TWB, Givaudan, Vinovalie, Dendris,...
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Admission

Pré-requis

Niveau(x) de recrutement

Bac + 3

Formation(s) requise(s)

Licence Biochimie et/ou Biologie Moléculaire et/ou Biologie cellulaire

Modalités de candidature

Les formations de Master sont ouvertes aux titulaires des diplômes sanctionnant les études du premier cycle (180 ECTS) ou équivalent et dans un domaine d’études correspondant. L’admission est prononcée à l’issue d’une procédure de sélection et en fonction des capacités d’accueil définies par l’établissement. Le dépôt des candidatures doit être effectué sur la plateforme nationale des Masters.

Modalités de candidature spécifiques

Lors du dépot de dossier sur la plateforme de candidature, pensez à indiquer dans votre lettre de motivation la spécialité (MM ou BDM) qui vous semble le plus en lien avec votre projet professionnel

Programme

Le syllabus est téléchargeable au format PDF. Le document comporte une présentation de l’année, le programme de chacune des Unités d’Enseignement (UE) avec la bibliographie associée ainsi que les coordonnées de l’enseignant responsable et du secrétariat de la formation.

Syllabus du M1 microbiologie
Syllabus du M2 microbiologie

  • En M1 : l'UE "initiation à la recherche" offre la possibilité d'effectuer un stage optionnel de 2 mois dans un laboratoire de recherche académique toulousain.
  • En M2 : un stage de recherche (ou R&D) obligatoire d'une durée de 5 à 6 mois sera réalisé dans une structure de recherche académique (université, CNRS, INRAE,...), semi-publique (CEA, IFREMER, IRD,...), ou privée.
Ces stages se dérouleront soit de janvier à fin juin, soit de fevrier/mars à fin août selon les spécialités

Oui
Les stages de fin d'étude à l'étranger sont possibles (pas d'obligation)

Alternance

Formation en alternance accessible uniquement sur 1 an en M2.
La formation initiale (présentiel à l'université) se déroule de début septembre à fin décembre

Et après ?

Compétences

  • Collecter ou produire des données bibliographiques ou expérimentales;
  • Concevoir et mettre en œuvre une stratégie expérimentale;
  • Actualiser ses connaissances par une veille dans son domaine de spécialité, en relation avec l'état de la recherche et l'évolution de la règlementation ;
  • Synthétiser l'état de l'art dans son domaine de spécialité en utilisant les principales sources d'information en exerçant son sens critique ;
  • Conduire dans son domaine une démarche innovante qui prenne en compte la complexité d'une situation en utilisant des informations qui peuvent être incomplètes ou contradictoires ;
  • Rédiger et exposer en français (par oral et par écrit) un projet ou un rapport scientifique d'une activité de recherche bibliographique ou expérimentale, en respectant un format imposé, à l'aide d'un support illustré approprié au public cible, en utilisant les outils courants de bureautique ;
  • Comprendre l'Anglais et s'exprimer aisément à l'oral et à l'écrit dans cette langue, en particulier être capable de lire, critiquer et présenter un document de la discipline ;
  • Développer et animer un projet de recherche ou développement en biotechnologie ;

Poursuites d'études

À l’UT3

  • Doctorat sur financements par concours des Ecoles Doctorales Biologie-Santé-Biotechnologies (BSB) ou Sciences Ecologiques, Vétérinaires, Agronomiques, Bio-ingénieries (SEVAB).
  • Doctorat sur financements internes aux laboratoires (ANR, Région, EPST) ou industrielles (CIFRE).